Самый идеал - черный на сером, у меня браузер так настроен, и в texstudio так (да даже в "либреофисе", хоть я им почти не пользуюсь). А вот черное на белом глаз режет.
Вопрос привычки, имхо. Например, PDF на +- белом (например, #FFFFF0) фоне смотрится нормально, как распечатка на бумаге.
В браузере уже хочется белый фон подкрутить до желтовато-серого и т.д.
ЗЫ
Светлый шрифт на темном фоне читается без напрягов, только если достаточно крупный.
Если при всех прочих равных шрифт темный на светлом фоне, то входной зрачок глаза уменьшается, при расфокусе/астигматизме шрифт четче. Возможно, поэтому.