Володя конечно ЦП не должен отвлекаться на всякие, в данном случае "посторонние" функции. Нужно отключать не только энергосбережение, вообще ни один лишний драйвер не должен загружаться, для этого нужно подчистить файл config.sys
Денис лучше знает, но предположу, что нужно снизить параметр Ms до 10.
Это же снижает разрешающую способность привода, всего 10 микрошагов на шаг получается.
В зависимости от скорости ЦП изменяется параметр PWMRepsTick, который влияет на максимальную скорость в микрошаговом режиме.