Изучал этот вопрос, в результате делаю следующим образом:
1. Дарки. Режим Авто-Оптимайз, сложение - усреднение.
2. Биасы. Сложение - усреднение.
3. Флэты. Сложение - усреднение, галочка бокскар включена.
В опциях - все птички отмечены, кроме "хот пиксел мэп".
Для примера - таблица с разными типами калибровки и получившимся с/ш для одиночного кадра из по 10 шт флэтов 2.5с, биасов 1/8000с и дарков 120с. Наибольший прирост отношения с/ш именно при данном методе. Изначально на исходнике было 7.11