На самом деле объяснение в общем правильное. Атмосферные неоднородности представляют собой слабые линзы, в результате действия которых искажается плоский волновой фронт света, т.е. в небольших пределах изменяется СХОДИМОСТЬ пучка. Следовательно, количество света, попадающее в глаз, непрерывно меняется, что и вызывает мерцание.
Можно провести такую аналогию – перед очень удаленным фонарем некто поставил отрицательную линзу. Ясно, что количество света, излучаемое в сторону наблюдателя, уменьшится (увеличится расходимость пучка). Однако сам фонарь останется для наблюдателя точечным источником. Т.к. ввиду удаленности фонаря и линзы, лучи света на входе глаза наблюдателя практически останутся параллельными, глаз не заметит никакой расфокусировки. А вот видимая яркость фонаря уменьшится. Это также хорошо объясняет почему мерцание увеличивается с возрастанием дальности (для земных объектов). Изменение сходимости пучка света на один и тот же угол вызывает бОльшие изменения количества света, попадающего в глаз, с ростом расстояния.
Кстати, нечто подобное можно наблюдать в темной комнате, разглядывая свет на стене от уличных фонарей, прошедший через оконное стекло. Все знают, что картинка на стене представляет собой узор из чередующихся темных и светлых полос, вызванный малыми отклонениями стекла от плоскости (т.е. своеобразными цилиндрическими линзами).
Особенность еще в том, что атмосферные линзы имеют малый характерный размер, распределены хаотически, очень быстро движутся и имеют вовсе не круглую форму. Мы всегда наблюдаем результат сложения от нескольких (многих) таких линз. Если посмотреть на сильно расфокусированное изображение звезды в телескоп, вы увидите характерную теневую картину из быстро бегущих темных полос и пятен. В результате чего интегральная яркость изображения меняется. Увеличение апертуры телескопа приводит к бОльшему усреднению действия таких неоднородностей и мерцание уменьшается.