Синтетическая жизнь

[T101]

Подан патент на синтетическую жизнь

Ученые из Института Крега Вентера несколько лет пытались вырастить синтетический микроорганизм с минимальным количеством генов на основе бактерии Mycoplasma genitalium, в которой они идентифицировали 265-350 жизненно важных генов. Новый организм должен был получить название Mycoplasma laboratorium. Исследования производились в режиме секретности. Еще в 2004 г. основатель института Крег Вентер (Craig Venter) заявлял, что синтетическая бактерия появится в конце года, но этого тогда не произошло.

И вот, наконец, подана патентная заявка и на сам синтетический организм, и на его геном, сообщает World Science. Генетически модифицированные организмы патентовали и раньше, но в данном случае, по мнению авторов патентной заявки, речь идет о полностью синтетическом геноме, созданном «с нуля» человеческими руками. В заявке говорится, что Mycoplasma laboratorium имеет 381-386 генов.

"Синтетическую" бактерию произвели путем удаления из Mycoplasma genitalium ее генетического материала, и введения синтетических генов, созданных химическими методами. Сложность таких разработок – не только в создании генов, но и их упаковке в клетке и регулировке деятельности.

По мнению создателей Mycoplasma laboratorium, проект может иметь коммерческое значение. Например, возможно создать бактерию, которая будет производить водородное или этанольное топливо. «Если мы сделаем бактерию, производящую топливо, она будет стоить миллионы и миллиарды долларов», - заявил Вентер. Ранее этот амбициозный ученый обещал за несколько лет добиться таких успехов в синтетической биологии, что нефть будет не нужна.

Достижения науки могут привести к тому, что организмы с нужными человеку свойствами можно будет не искать в природе или модифицировать, а производить в короткие сроки «с нуля». Теоретически развитие синтетической биологии приведет к созданию и синтетических многоклеточных организмов.

http://rnd.cnews.ru/natur_science/news/top/index_science.shtml?2007/06/08/254117

[Nucleosome]

Что-то не совсем ясно... синтетические гены это как? Совершенно новые ни что не похожие? Не верю! (с) Они наверное просто взяли синтезировали ДНК известных генов. Да и потом, если речь идёт о клонировании генов в готовый организм с изъятием его личных генов, то это уже не совсем синтетическая жизнь. И потом, не ясно, почему они пишут о синтезе веществ именно такими организмами? можно ведь и более простыми генно-инженерными манипуляциями получить такой эффект.

[turchin]

может быть, это попадает под действие вот этого приза:
http://lifeboat.com/ex/main

A-Prize

Цель.
PURPOSE
 
Цель A-Prize  - сделать исследования искусственных жизненных форм открытыми, как они и должны быть. В настоящий момент многие исследования по развитию искусственной жизни в недостаточной степени предаются гласности. A-PRIZE будет служить в качестве координационного информационного центра относительно гонки с целью «Прорвать углеродный барьер». Сейчас, когда многие крупные университеты и компании мчатся наперегонки к созданию небиологической жизни, как раз подходящее время для создания такого информационного центра.

В нашем мире, где на Нанобиотехнологии (под разными личинами – включающими Синтетическую биологию, Искусственную жизнь, Биологическое конструирование и т.д.) тратятся миллиарды долларов в год в глобальной гонке за прорыв Углеродного барьера – пора сосредоточится на этой проблеме.

Бактерия с нестандартной ДНК будет иммунной к бактериофагам и в силу этого будет иметь большие шансы, чтобы стать широко распространённым агрессивным видом. Это может разрушить экосистемы в масштабах, о пределах которых мы даже не имеем представления. Так что давайте попытаемся открыто и ответственно развивать искусственную жизнь, проводя исследования открыто и  направляя исследования в более безопасное русло.

ОБЗОР
OVERVIEW

A-PRIZE был создан членом нашего Научного Совета Аланом Голдстейном, который является соавтором выходящего каждые три года обзора Национального исследовательского Совета под названием «Национальная Нанотехнологическая Инициатива» (NNI). Свой вклад внесли другие члены нашего Научного Совета, включая Криса Феникса и Марка Ротштейна.
Читайте наше интервью с Аланом Голдштейном!

Он присуждается человеку или организации, отвечающему за создание Искусственной жизни (Аниматов), который уделяет особое внимание безопасности исследователей, общества и окружающей среды – ИЛИ человеку или организации, который покажет, что Аниматы/Искусственная жизнь были созданы. (Второй случай предназначен для обнаружения неопубликованных или небезопасных проектов.)

[Nucleosome]

Бактерия с нестандартной ДНК будет иммунной к бактериофагам и в силу этого будет иметь большие шансы, чтобы стать широко распространённым агрессивным видом. Это может разрушить экосистемы в масштабах, о пределах которых мы даже не имеем представления.

Не только Фаги враги бактерий, в природе антибиотики тоже есть. Кроме того, бактерия для фага это прежде всего среда, фаг может и собой принести полимеразу, котоаря размножит его ДНК, соединившуюся в кольцо, отдельно от ДНК бактерий. У бактерий было три миллиарда лет минимум, на протяжении которых они воевали с фагами, при этом не стандартная ДНК появилась у фагов - некоторые из них насаживают на обычную ДНК части сахаров, делая её недоступной для энзимов рестрикции - тех, что режут ДНК. И если за это время не появилось бактерий способных размножится и кардинально изменить мир, то наверное есть нечто существенное, что мешает им это. И это что-то это многоуровневая система защиты от черезмерно плодящихся особей.

[T101]

Вот, информации появилось больше.

Русская статья на мембране:
http://www.membrana.ru/lenta/?7410

Пресс-релиз института:
http://www.jcvi.org/press/news/news_2007_06_28.php

Статья авторов:
http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/1144622

Так же на мембране любопытная пара статей про довольно масштабный проект "Жизнь 2.0" с сылками на исследовательские институты:
http://www.membrana.ru/articles/global/2004/09/03/202100.html
http://www.membrana.ru/articles/global/2005/02/02/200300.html

[Nucleosome]

Только сейчас сюда добрался... если честно, то не очень пойму на что направлены усилия - заменить весь геном - ну можно - много операций надо провести, но рутинных и достаточно банальных. И что в итоге? Ну создадим этакого гибрида, но ведь более тривиальными способами модно получать фактически тоже самое. Ситуация напоминает когда появилась информация о синтезе вируса - взяли в пробирках синтезировали ДНК, сначала нуклеотиды, потом олигонуклеотиды,п отом схивали их. Синтезировали. На молбиоле про это сказали "при полном отсутсвии идей и сильном желании прославится". И я полностью согласен - что толку что сделали кучу рутинных процедур вместо пары десятков? Боюсь, что тут нечто близкое.

[T101]

А что скажете про Жизнь 2.0 ?

[Nucleosome]

А это что?

[T101]

Так же на мембране любопытная пара статей про довольно масштабный проект "Жизнь 2.0" с сылками на исследовательские институты:
http://www.membrana.ru/articles/global/2004/09/03/202100.html
http://www.membrana.ru/articles/global/2005/02/02/200300.html

[Nucleosome]

Извените, я что-то проглядел...
Ну в общем, слишком как бы сказать "помпезно" называть это новой жизнью - это продвинутая генная инженрения, котоаря строится вс равно на существующих организмах, и я считаю нет пока никакой нужды пытаться "шоб было" сделать нечто принципиально новое. Там и про вирус упомянтуо, о котоом я тоже говорил.
Я конечно, понимаю - говоря "новая жизнь" легче получить грант чем если сказать, что мы делаем очередной продукт геной инженерии, пусть даже и продвинутый. Между прочим, системы позволяющие включать заданный ген, в присутвии нужного вещества есть, и даже не слишком тяжело это соррудить - берём нужный промотер (это участок ДНК запускающий ген), который активизируется от нужного вещества, встраиваем это всё клонируем... (ну я упрощённо, понятно говорю ). Конечно, не со всеми веществами удаётся пока найти подходящие гены.
О новой жизни можно будет говорить тогда, когда будет сконструирован принципиально новый ген - такой, который был бы ни на кого не похож, и который вополнял бы соверешнно новые для живого мира функции - к примеру идеальные алмазы бы синтезировал . Или нонодиспелии компов собирал

[LUKA]

Бактерия с нестандартной ДНК будет иммунной к бактериофагам и в силу этого будет иметь большие шансы, чтобы стать широко распространённым агрессивным видом.

Напоминает душещипательные сказки про ГМО для впечатлительных бюргеров. ДНК "нестандартная" - это что-то из натурфилософии.
ДНК - та же самая. Первичная структура (последовательность нуклеотидов) может быть другая, другие гены - ДНК та же.
Что касается иммунитета конктретно к фагам, то, как известно сейчас, есть по крайней мере две имунные системы -
1) система рестрикции-модификации (один фермент режет фаговую ДНК, другой метилирует свою, чтобы не порезать себя)
2) система, связанная с кодированием антисмысловой РНК (иммунитет наследуется, однако, если часто не применяется к какому-то фагу, то теряется, но может появиться к другому виду вируса). http://elementy.ru/news/431239

"Нестандартность" здесь ни при чём.