1. Я выправлял подобные дефекты и даже добивался чтоб было незаметно. Для этого нужно выточить оправку из стали, точно совпадающую по диаметру с внутренним диаметром резьбы под светофильтр, внутри оправки отверстие миллиметров 20-30. Из получившегося "бублика" вырезаем ножовкой сектор, сопоставимый по размеру с повреждённым местом и делаем в нём отверстие с резьбой таким образом чтоб при закручивании винта сектор выдвигался наружу, выдавливая тем самым гнутую оправу. По крайней мере, линзу вы выкрутите. Если нужен товарный вид, необходимо при выпрямлении постукивать аккуратно молоточком по повреждённому месту, визуально контролируя качество. Если впридачу резьба помята, её можно легко процарапать метчиком с тем же шагом, а потом это место покрасить.
3. Если хорошенько сдавить этот линзовый блок в оправе, то скорее всего склейка восстановится и пятна исчезнут( по крайней мере у меня так бывало). Можно расклеить вовсе, промыть спиртом и склеить канадским бальзамом( лучше бальзамин, но это только в заводских условиях). Как-то в детстве я склеивал линзы простой водой и получалось супер. Когда вода высыхала, не было никаких разводов и линзы держались как мёртвые.
4. Лично я при разборке объективов(а прошло через меня их достаточно) пользуюсь небольшой воздуходувкой, работая в струе воздуха. С пылью тогда проблем не возникает.
Отдельные пылинки, даже когда их много практически не влияют на качество объектива, неприятно только психологически. Гораздо страшней налёт из мелких масляных капелек, образующихся от смазанных лепестков диафрагмы на внутренних поверхностях прилегающих к ней линз. Этим страдают практически все старые объективы. Удалив их можно сразу поднять контраст. Не рекомендую стирать их спиртом - ведь это же масло. Его сколько ни трёшь, а оно размазывается по линзе и никуда не девается. Лучше всего взять сухие салфетки, предназначенные для протирки оптики и с лёгким прижимом потереть поверхность линзы. Вы сразу почувствуете когда она станет чистой.
5. Я считаю, что при съёмке цифровиком лучше всего делать пробные снимки(ведь плёнка не расходуется) и раз и навсегда отметить лучшее положение фокусировочного кольца. Если видоискатель ФА хорошо отъюстирован, то что мешает настраивать резкость по нему? Для большей точности можно смотреть через небольшую зрительную трубку.