В ходе юстировки Вы, по-видимому, сместили одну или несколько призм вдоль хода лучей, от объективов или к объективам. Поскольку в каждой призме луч отражается дважды, результирующее изменение хода луча удваивается. Например (см. схему), если призма удалилась от объектива на 0.5мм(изменение выделено красным), то ход луча удлинился на 1мм. Если бино фокусируется и вблизи и на бесконечность и при этом не двоит, то, в принципе, можно оставить как есть.