Вопрос к биохимикам

[Combinator]

Насколько реальным выглядит существование чего-нибудь типа "мира РНК" в растворителе, отличном от H2O, например, в нефтеподобной среде?

[Константин ВАРБ]

Идеальны аммиачные, аммиачно-водные, аммиачно-спиртовые, аммиачно-водно-спиртовые растворы.
«РНК-эволюция» - это такой «сферический конь в вакууме».

Но как я понимаю, Вы спрашиваете с прицелом на Титан?
Вот там, по тому, что пока видно в наличие:
1)   Каталическая органика в атмосфере.
2)   Мембраны на поверхности. 

Есть ли там что-то типа РНК в морях и лужах пока не известно.
Возможно, в них есть что-то сложенное из двух первых элементов и более сложное.

Однако в земной нефти вроде бы никаких нефтяных «амёб» не находили.

В общем одни вопросы.

[SY]

Насколько реальным выглядит существование чего-нибудь типа "мира РНК" в растворителе, отличном от H2O, например, в нефтеподобной среде?

В неполярном растворителе растворяется очень мало различных веществ, поэтому там любая эволюция выглядит проблематичной из-за узкого выбора возможных для реакций веществ.

[Combinator]

Идеальны аммиачные, аммиачно-водные, аммиачно-спиртовые, аммиачно-водно-спиртовые растворы.
«РНК-эволюция» - это такой «сферический конь в вакууме».

Но как я понимаю, Вы спрашиваете с прицелом на Титан?
Вот там, по тому, что пока видно в наличие:
1)   Каталическая органика в атмосфере.
2)   Мембраны на поверхности. 

Есть ли там что-то типа РНК в морях и лужах пока не известно.
Возможно, в них есть что-то сложенное из двух первых элементов и более сложное.

Однако в земной нефти вроде бы никаких нефтяных «амёб» не находили.

В общем одни вопросы.

Я не могу сказать, что вопрос конеретно про Титан. Вопрос скоре связан с тем, что "голая" РНК, как известно, в водном растворе быстро деградирует (гидролизуется). В современных клетках "уязвимые" места РНК обычно прикрыты белками и, тем не менее, время жизни в цитоплазме, насколько я понимаю, у них обычно не очень большое.  Но при зарождении жизни защита явно была слабее, а на долю РНК должно было выпадать гораздо больше работы, чем сейчас. Вот я и раздумываю, как им удавалось активно функционировать и размножаться в весьма агрессивной для них среде?

[Combinator]

Насколько реальным выглядит существование чего-нибудь типа "мира РНК" в растворителе, отличном от H2O, например, в нефтеподобной среде?

В неполярном растворителе растворяется очень мало различных веществ, поэтому там любая эволюция выглядит проблематичной из-за узкого выбора возможных для реакций веществ.

Спасибо, это аргумент действительно важный.

[AlexAV]

неполярном растворителе растворяется очень мало различных веществ, поэтому там любая эволюция выглядит проблематичной из-за узкого выбора возможных для реакций веществ.

Неполярные - да. Но вот для аммиака и аммиачно-водной смеси противопоказаний вроде как нет.

[Константин ВАРБ]

Но при зарождении жизни защита явно была слабее, а на долю РНК должно было выпадать гораздо больше работы, чем сейчас. Вот я и раздумываю, как им удавалось активно функционировать и размножаться в весьма агрессивной для них среде?

Да никак.

Возможно я сильно отстал от "передового края науки" за текущее тысячелетие биотехнологи научились с помощью супер ЭВМ многое создавать и внедрять... , но РНК - это по сути это станок для производства инструментов = (белков), сам по себе этот станок (сферический конь) не работает.

Вначале мембраны и катализаторы белки, а только потом РНК и ДНК, а не наоборот. Тем более что механизмы структурирования клетки (= системы мембран)  пока очень далеки от не то чтобы понимания, а внятного объяснения.
Вроде придумывают какие-то нанозонды; может кому хватит терпения, наблюдательности и времени...
Пожелаем удачи!

[Константин ВАРБ]

В неполярном растворителе растворяется очень мало различных веществ, поэтому там любая эволюция выглядит проблематичной из-за узкого выбора возможных для реакций веществ.

Подобное стремится к подобному в неполярном растворители вполне неплохо растворяются неполярные же вещества.
Мы же не всякую грязь в воде отстирываем, некоторую в бензине

[Combinator]

Да никак.

Возможно я сильно отстал от "передового края науки" за текущее тысячелетие биотехнологи научились с помощью супер ЭВМ многое создавать и внедрять... , но РНК - это по сути это станок для производства инструментов = (белков), сам по себе этот станок (сферический конь) не работает.

Другими словами, Вы в "классическую" теорию РНК мира не верите, так?

[Константин ВАРБ]

Другими словами, Вы в "классическую" теорию РНК мира не верите, так?

Почему же верю, но хотелось бы вначале посмотреть на тот "агар-агар" в котором они будут самостоятельно плодиться.

[Combinator]

Другими словами, Вы в "классическую" теорию РНК мира не верите, так?

Почему же верю, но хотелось бы вначале посмотреть на тот "агар-агар" в котором они будут самостоятельно плодиться.

Понял.

[SY]

Вначале мембраны и катализаторы белки, а только потом РНК и ДНК, а не наоборот.

Все же мне, лично, кажется, что РНК первично, т.к. именно они синтезируют белки(тРНК,рРНК,иРНК,АТФ) и связывают логически ДНК с белками, и кроме того потенциально способны к саморепликации. Вся энергетика клеток основана на РНК, без них многие реакции с затратой энергии не были бы возможны

[Combinator]

Все же мне, лично, кажется, что РНК первично, т.к. именно они синтезируют белки(тРНК,рРНК,иРНК,АТФ) и связывают логически ДНК с белками, и кроме того потенциально способны к саморепликации. Вся энергетика клеток основана на РНК, без них многие реакции с затратой энергии не были бы возможны

Всё таки мне кажется не совсем правильно относить к РНК АТФ и коферменты, имеющие в своём составе 1-2 нуклеотида. Кроме того, тот же пирофосфат в качестве источника энергии мало чем уступает АТФ.

[Константин ВАРБ]

Вначале мембраны и катализаторы белки, а только потом РНК и ДНК, а не наоборот.

Все же мне, лично, кажется, что РНК первично, т.к. без них многие реакции с затратой энергии не были бы возможны

Мусор я вырезал.
А вот с этим соглашусь!

Только с чего Вы взяли что первичные реакции должны идти с затратой энергии?
Для того чтобы ставить (забыл как их правильно называют) ГЭС пиковой нагрузки и закачивать в них энергию в отсутствие оной, надо вначале создать единую сеть ГЭС, а до этого каждую по отдельности, но не наоборот.

[Константин ВАРБ]

Вот этот критерий наличие энергетически затратных реакций, вероятно и есть маркер границы жизнь/протожизнь.

[Combinator]

Вот этот критерий наличие энергетически затратных реакций, вероятно и есть маркер границы жизнь/протожизнь.

Вообще-то эндотермические реакции встречаются в природе едва ли не на каждом шагу....

[Константин ВАРБ]

Вообще-то эндотермические реакции встречаются в природе едва ли не на каждом шагу....

Да, некорректно сформулировал.
Но сейчас мозги совершенно на другое перестроены, так, что увы...

[SY]

Для того чтобы ставить (забыл как их правильно называют) ГЭС пиковой нагрузки и закачивать в них энергию в отсутствие оной, надо вначале создать единую сеть ГЭС, а до этого каждую по отдельности, но не наоборот.

Проводя аналогию, я бы сравнивал АТФ с энергосистемой, а фото- и хемо- синтезы уже с ГЭС и АЭС, потому, что АТФ - это сама основа энергетики клеток.