Планетам вообще пофиг. Будут "полоскаться" в танце столкновения галактик вместе со своей звездой, вокруг которой вращаются. Само столкновение практически никак не вредит орбитам. Другое дело, что может вредить пролёт звёзд соседней галактике в гуще звёзд нашей и изменение скоростей и направления их движения. Это да, может вызвать перестройку внешней части планетной системы, пертрубацию с облаком Орта (и соответственно проникновению комет внутрь планетной системы). Так же слияние галактик-это мощный катализатор звёздообразования. А это значит, что возможно попадание планетной системы в малоустойчивые динамичные области со взрывами сверхновых, возникновением рядом массивных ярких звёзд,что не совсем хорошо.
Ну и сам процесс длится чрезвычайно медленно и долго. Например нашей Галактике через 4 млрд лет суждено столкнуться с галактикой Андромеды. Однако через 4 млрд лет Солнце будет находиться на закате своей истории в стадии красного гиганта. Это уже опасно для Земли. А ещё до столкновения оно успеет раз 15 крутануться вокруг ядра Галактики.
