Павел, вопрос о зоне обитаемости зависит от характеристик планеты, таких, как масса, наклон оси вращения планеты к плоскости орбиты, состав атмосферы, характеристик глобальной циркуляции атмосферы на планете, очертания материков и характер циркуляции воды в океане, ... При таком количестве данных можно лишь очень приближенно судить о зоне обитаемости.
Что касается софта по этой проблеме, то тут нужно иметь полную модель планеты с учетом всех перечисленных факторов. В СССР группой под руководством Моисеева была в свое время составлена подобная программа (модель "Гея"). Аналогичные работы были проведены и в США группой К. Сагана. Вот, в сущности, и все, что делалось по этому поводу. Естественно, в интернете таких программ нет.
По поводу устойчивости планетной системы. Есть статья по этому поводу
http://proceedings.usu.ru/koi8/metod_materials/wm3/dynamics.htmЕсли хотя бы просмотрите эту статью, поймете, что вопрос об устойчивочти окончательно не решен. Это предмет изучения серьезными учеными и популярной программы по этому поводу, вроде, не существует.
А для фантастики незачем проводить такие трудоемкие исследования, пусть пишет интуитивно правдоподобные вещи, вот и все. Аналогия - солнечная система.