Ссылки на новости по тематике раздела "Вселенная, Жизнь, Разум"

[Maki]

https://brighterworld.mcmaster.ca/articles/discovery-of-tools-from-two-million-years-ago-shows-how-early-humans-adapted/
Читается с гуглопереводом.

Международная группа, в которую вошли канадские исследователи из Университета Калгари и Макмастера, обнаружила в Танзании каменные орудия, возраст которых составляет два миллиона лет, что является самым старым свидетельством человеческой деятельности в так называемой Колыбели человечества.

2.000.000 

[crazy_terraformer]

Homo habilis?

[Maki]

Homo habilis?

Он, наверное. Кто бы ещё?

[Maki]

Забавная статья о причудах мимикирии. https://elementy.ru/kartinka_dnya/1298/Babochka_mukhi_i_ptichiy_pomyot?from=bxblock

[Серый Страж]

Созданы первые синтетические бактериофаги
https://nplus1.ru/news/2021/01/28/synthetic-phages

Ученые из Португалии создали бактериофаги с укороченным геномом и описали их. Это первая успешная попытка создать синтетические бактериальные вирусы. Авторы надеются, что их исследование поможет при создании новых антибактериальных веществ. Работа опубликована в Scientific Reports.

Геномы бактериофагов небольшие, однако и в них встречаются участки (довольно большие, до 80 процентов генома), функции которых ученым пока неизвестны. Есть некоторая вероятность, что белки, кодируемыми неизвестными генами, могут быть вредными для человека. Кроме того, «целые» геномы неудобны для дальнейшего манипулирования, например, добавления необходимых для терапевтических целей генов. Удаление генов с неизвестными функциями позволило бы оставить только известные и безопасные гены и освободить место для новых.

Подобные опыты по минимизированию геномов уже проводились на живых объектах. Известность получили работы, выполненные под руководством биолога Крейга Вейнтера (J. Craig Venter) по созданию бактерии с минимальным геномом. Тогда ученые определили часть генов бактерии Mycoplasma mycoides как «не жизненно необходимые» и удалили их, получив, по сути, новый синтетический организм. Подробнее об этом направлении в синтетической биологии можно прочитать в материале «Прожиточный минимум».

ученые предположили, что из генома бактериофага PE3 можно вырезать два модуля генов, которые, вероятно, кодируют белки: с первого по пятый (gp1-gp5) и с шестого по двенадцатый (gp6-gp12). Авторы работы создали три варианта синтетического генома: в двух удалили по одному из модулей, и в третьем удалили оба

Чтобы лучше понять, как нокаут генов повлиял на бактериофаг, авторы работы сравнили его жизнеспособность с диким типом. Во-первых, фаговые бляшки уменьшились в размерах.

Во-вторых, не все синтетические бактериофаги смогли инфицировать те же штаммы синегнойной палочки, что и их предшественник. Только фаги с делецией модуля gp6-gp12 оказали значительный эффект на 7 из 28 клинических образцов P. aeruginosa, остальные инфицировали лишь 4 штамма. Кроме того, фаги с делецией gp6-gp12 демонстрировали темпы роста, схожие с РЕ3, в то время как фаги с делециями gp1-gp5 и gp1-gp12 отставали на пять и пятнадцать минут, соответственно.

В то же время, антибактериальная эффективность бактериофагов не пострадала от проведенных манипуляций. Это выяснилось в ходе in vitro экспериментов, где к бактериальным культурам, находящимся в экспоненциальной фазе роста, добавили бактериофаги. Соотношение вирусных частиц к клеткам составило 1:5. Все варианты фагов проявили одинаковую эффективность, значительных различий не наблюдалось ( р > 0,01). 

Также исследователи протестировали терапевтическую эффективность синтетических бактериофагов in vivo на Большой восковой моли (G. mellonella). После инфицирования бактериями, насекомым ввели растворы с бактериофагами. Спустя 24, 48 и 72 часа выживаемость в контрольной группе составила, соответственно, 20, 13 и 10 процентов. Получившая лечение бактериофагами группа продемонстрировала лучшие результаты (р < 0,05): их выживаемость составила 50 процентов спустя 24 часа, и 30 процентов спустя двое и трое суток. При этом со своей задачей одинаково хорошо справились и синтетические бактериофаги, и их природный предшественник.

P.S. Ссылка на упоминаемый в заметке материал:

Прожиточный минимум
https://nplus1.ru/material/2016/03/25/minimalgenome
Что такое минимальный геном и как он продвигает нас к созданию синтетической жизни

[Rattus]

Вообще первый "синтетический" вирус создан 18 лет назад. Так что это вполне рядовая работа на сегодняшний день.

[Olweg]

Международная группа, в которую вошли канадские исследователи из Университета Калгари и Макмастера, обнаружила в Танзании каменные орудия, возраст которых составляет два миллиона лет, что является самым старым свидетельством человеческой деятельности в так называемой Колыбели человечества.

2.000.000 

Так а в чём сенсация? Есть же и более древние:
https://antropogenez.ru/single-news/article/810/

(про 3.3 млн лет, кстати, не знал)

[Серый Страж]

У атрибактерий из горячих источников есть внутренняя цитоплазматическая мембрана
https://elementy.ru/novosti_nauki/433764/U_atribakteriy_iz_goryachikh_istochnikov_est_vnutrennyaya_tsitoplazmaticheskaya_membrana

За последние годы геномные методы позволили обнаружить большое количество новых таксонов микроорганизмов и вирусов. При этом изучение их биологии и строения происходит чрезвычайно медленно, в частности, потому что исследователи не знают, как их выделить и как культивировать в условиях лаборатории. Тип-кандидат Atribacteria обнаружили в горячих источниках Йеллоустона еще в 1998 году с помощью исследования метагеномов, но только сейчас японским ученым удалось вырастить культуру этих бактерий и изучить их строение. Оказалось, что атрибактерии имеют необычную многослойную структуру и большое количество генов, связанных с формированием и функционированием мембран. Одна из интерпретаций находки — эта многослойная структура является прообразом ядра. Возможно, атрибактерии немного приблизят ученых к пониманию того, как возникли ядерные организмы.

[Серый Страж]

Физики отделили «рычание» квантового Чеширского кота от «улыбки»
https://nplus1.ru/news/2021/02/10/grin-vs-snarl

Физики предложили эксперимент, в котором разные виды поляризации фотона детектируются только в разных плечах интерферометра в экспериментах с пост-селекцией. Он является развитием идеи эксперимента по наблюдению «квантового Чеширского кота», только в этом случае разные поляризации играют роль «улыбки» и «рычания» «кота». Авторы описали метод, позволяющий менять поляризации местами с помощью добавления новых оптических элементов, и обнаружили в такой схеме эффект «отложенного выбора». Работа опубликована в Physical Review Letters, а также на сайте для препринтов arxiv.org.

[Серый Страж]

Открыт механизм прекращения старения. И лекарство для омоложения
https://www.popmech.ru/science/news-673903-otkryt-mehanizm-prekrashcheniya-stareniya-i-lekarstvo-dlya-omolozheniya/?from=main_3
P.S. Насколько я понял, открыли, как можно нивелировать один из факторов старения.

[Серый Страж]

Исследователи пообщались со спящими людьми, вторгаясь в их сны
https://www.popmech.ru/science/news-674233-issledovateli-poobshchalis-so-spyashchimi-lyudmi-vtorgayas-v-ih-sny/?from=main_3

Исследователи смогли успешно «поговорить» со спящим человеком в режиме реального времени, вторгаясь в его сны. Работает это только в редком состоянии осознанного сна.

[Серый Страж]

Для усложнения строения грудных плавников данио-рерио достаточно замены одного нуклеотида
https://elementy.ru/novosti_nauki/433772/Dlya_uslozhneniya_stroeniya_grudnykh_plavnikov_danio_rerio_dostatochno_zameny_odnogo_nukleotida

Конечности четвероногих — замечательное приспособление, сыгравшее колоссальную роль в освоении суши позвоночными. Превращение плавников в конечности было связано с постепенным усложнением их структуры.

В ходе широкомасштабного скрининга ученые из США неожиданно обнаружили две мутации, каждая из которых приводит к появлению дополнительных длинных костей в грудных плавниках у рыбок Danio rerio. Более того, эти новые кости образуют суставы с соседними костными элементами и интегрируются с мышечной тканью. Мутации затронули гены vav2 и wasl. Результатом мутаций становится усиление экспрессии гена hox11 в зачатках плавников, что, в свою очередь, приводит к появлению дополнительных костей и суставов. Эти же гены важны и для нормального развития предплечья у мышей.

Особенно поражает тот факт, что одна мутация оказалась способна вызвать скачкообразное усложнение (а не упрощение, как это бывает гораздо чаще) структуры тела. Это показывает наличие скрытого потенциала к усложнению в программе развития плавников, и похоже на то, что этот потенциал как раз и был реализован в ходе эволюции древних рыб, позволив позвоночным, в конце концов, освоить наземную среду.

[Серый Страж]

Спастись от клеток-читеров помогает только изоляция
https://elementy.ru/novosti_nauki/433779/Spastis_ot_kletok_chiterov_pomogaet_tolko_izolyatsiya

Их можно было бы назвать эгоистами, жуликами, обманщиками или эксплуататорами. Но авторы статьи в Nature Communications, посвященной этому феномену у хлебной плесени (Neurospora crassa), предпочитают слово «читер». В отличие от прочих имен, оно не приписывает грибам-мутантам преступных намерений, — а лишь подчеркивает тот факт, что эти грибы используют фундаментальный принцип устройства многоклеточных организмов для получения личной выгоды. И если присмотреться внимательнее, то оказывается, что тот же принцип приводит к появлению «читеров» и в организме животных. Защититься от них, как показывает практика, можно, только лишив их возможности пользоваться общими ресурсами, — но у животных эта сегрегация приводит к другим последствиям, чем у грибов.

P.S. Статья большая и многоплановая, много ссылок на любопытные материалы.

[Серый Страж]

В ходе адаптации к теплу или холоду ферменты находят одни и те же решения типовых эволюционных задач
https://elementy.ru/novosti_nauki/433780/V_khode_adaptatsii_k_teplu_ili_kholodu_fermenty_nakhodyat_odni_i_te_zhe_resheniya_tipovykh_evolyutsionnykh_zadach

Американские химики и биологи провели беспрецедентное по масштабу исследование закономерностей эволюции белков на примере адаптации ферментов к высоким и низким температурам. Адаптация к холоду, как правило, требует повышения каталитической активности фермента, а при высокой температуре на первый план выходит проблема стабильности его трехмерной структуры. Как выяснилось, баланс между активностью и стабильностью может определяться одним-единственным аминокислотным остатком в активном центре фермента. Например, если у фермента кетостероид-изомеразы в ключевой позиции №103 стоит аспарагиновая кислота (D103), фермент высокоактивен, но не очень стабилен, а если там находится серин (S103), то все наоборот. Самое интересное, что эти эффекты мало зависят от того, какие аминокислоты стоят во всех остальных позициях (это называют «слабым эпистазом»).

В результате получается стандартный и легко проходимый эволюционный путь, доступный организмам с самыми разными версиями кетостероид-изомеразы. И действительно, в ходе адаптации к холоду в разных эволюционных ветвях бактерий много раз независимо закреплялся вариант D103, а в ходе адаптации к теплу — S103. Анализ 2194 типов ферментов (белковых семейств) у 5852 видов бактерий с известными геномами и температурными оптимумами показал, что эти особенности температурной адаптации — важность единичных замен, слабый эпистаз и вездесущие параллелизмы — характерны для многих ферментов.

[Серый Страж]

Новая теория памяти – прорыв или утопия?
http://neuronovosti.ru/new_theory_of_memory/

В конце февраля в журнале Frountiers in Molecular Biology вышла статья Бенжамина Гульта (Benjamin Goult), в которой он предложил свою теорию формирования памяти. Эта теория смогла объяснить, в какой форме находятся воспоминания в мозге, почему порой они исчезают, почему мы способны вспоминать за считанные секунды, где физически находится память. Об этой статье сразу же написали в целом ряде новостных изданий, назвав теорию Гульта революционной. Но действительно ли это так?

[Серый Страж]

Биологи составили метаболический портрет последнего общего бактериального предка
https://nplus1.ru/news/2021/04/02/lbca

[Серый Страж]

Культура у животных — не редкий курьез, а вездесущее явление
https://elementy.ru/novosti_nauki/433801/Kultura_u_zhivotnykh_ne_redkiy_kurez_a_vezdesushchee_yavlenie

[Серый Страж]

Планеты земного типа могут обладать встроенным ликвидатором сложной жизни
https://naked-science.ru/article/sci/planety-zemnogo-tipa-mogut-obladat-vstroennym-likvidatorom-slozhnoj-zhizni

[Проходящий Кот]

1.5 миллиона лет ---- был для жизни на Земле, если бы лысые обезьяны не дорвались до угля и нефти.
Деятельность ГРИНПИСовцев ОБЪЕКТИВНО направлена на уничтожение людей и развитой жизни на ЗЕМЛЕ.

[Novosedoff]

Любопытная новость на Хабре мелькнула про возможность океанов и жизни на Венере-Марсе в далёком прошлом 
https://habr.com/ru/company/skillfactory/blog/554446/